1945年9月20日，中共中央将江南新四军全部北撤的命令电告华中局。当天，华中局即转发中央电令，要求“浙东部队及地方党政干部立即全部撤退，留下秘密工作及少数秘密武器”。9月22日，华中局再次就北撤工作的具体安排电示浙东区党委，要求留下部分熟悉地形、民情、与群众有密切联系的干部，领导坚持原地斗争，并组织新四军后方留守处。

根据中共中央和华中局的命令，浙东区党委对新四军浙东游击纵队和干部北撤后浙东地区的隐蔽斗争工作做了相应的安排。浙东区党委专门成立了新四军浙东游击纵队留守处，由王剑鸣（后随军北撤）、朱洪山任正、副主任，黄明负责后方医院工作，以公开合法的身份，就安排伤员、回收抗币、处理物资等北撤的善后事宜与国民党谈判。在党组织布置方面，在各地设立单线联系的特派员制。四明地区特派员为刘清扬和邢子陶（不久去苏北解放区），三东地区特派员为王起，金萧地区特派员为马青，台属地区党组织由刘清扬兼管。

浙西新四军于北撤途中，也对苏浙皖边留守坚持斗争作了部署。1945年10月5日，苏浙区党委在江苏宜兴张渚召开会议，决定成立中共苏浙皖特委，对外称新四军苏浙皖边区留守处，陈立平任书记；在军事组织上，建立苏浙皖边区司令部，熊兆仁为司令员，陈立平为政委。这样，包括边区特委机关在内，整个苏浙皖边留守人员1000人左右。会后，茅山、太滆、郎广、浙西4个工委同时建立。

中共浙西工委对外称新四军浙西留守处，杜大公任书记兼留守处主任，主要负责吴兴、德清、武康、安吉、孝丰、余杭、临平7个县的工作。浙西工委直属留守武装为1个警卫大队，共120余人。属郎广工委领导的长兴县也留下由10多人组成的武工队坚持斗争。此外，浙西特派员罗希明根据苏浙皖特委的指示，继续领导嘉兴、吴兴、崇德等地下党坚持原地斗争。

在浙东、浙西新四军北撤后，浙南地区的永乐人民抗日自卫游击总队成为国民党军进攻的重要目标。根据华中局指示精神，浙东区党委书记谭启龙写信给浙南特委书记龙跃，告知浙东部队已经奉命北撤，浙南应当整顿部队、实施精简、分散隐蔽，以便长期在国统区坚持斗争。

1945年11月20日，中共浙南特委明确此后的基本任务是：“坚持执行隐蔽精干政策，保存积蓄力量，坚持阵地，渡过困难，最后达到配合全国、争取和平民主团结实现。”永乐人民抗日自卫游击总队撤销番号和建制，由原先的700余人，精简到100人，组成8个武工队，深入括苍山区开展活动。海上大队建制未变，队员适当精简，继续坚持在乐清湾各海岛活动。

此外，战斗在浙西南地区的中共处属特委和闽浙边临工委，根据浙东新四军北撤前夕谭启龙的指示精神，执行“隐蔽精干、长期埋伏、积蓄力量、等待时机”方针，将干部、武装分散，重新开始独立坚持斗争。

浙江各地留守坚持的力量，在极其艰难的情况下，与国民党当局展开英勇的斗争，顽强地坚持了下来，为全面内战爆发后重建武装、开展游击战争创造了有利的条件，为浙江的解放积蓄了力量。