鄂尔多斯市蒙医医院始建于1979年，历经四十余载发展，现已成为一所集蒙医医疗、科研、教学、蒙药制剂为一体的国家三级甲等蒙医综合医院。医院设康巴什部、康巴什北区康复中心、东胜部三个院区，占地面积5.5万平方米，建筑面积6.5万平方米，开放床位415张，在岗职工557人，其中卫生技术人员464人，占比83.3%，高级职称人员88人、博士4人、硕士研究生39人。有临床科室29个、医技科室9个，并有独立的蒙药实验室和蒙药制剂中心，拥有64排螺旋CT、3.0T核磁共振、全自动生化免疫一体机等先进诊疗设备，能够满足广大患者的就医需求。是国家医师资格实践技能考试基地、国家住院医师规范化培训基地、国家中医药文化宣传教育基地，连续两年获评国家三级公立医院绩效考核指标A级。

医院以铸牢中华民族共同体意识为主线，以政治引领为核心、以责任落实为抓手、以学科建设为突破的发展路径。打造“红石榴”党建品牌，构建“党建+”发展模式。在党建引领下，医院科研创新成果丰硕，累计实施科研项目40余项，研发蒙药滋补膏、茶包、穴位贴等新剂型，生产制剂品种200多个。其中，“蒙药让阿嘎日-8片剂”获自治区重大科研项目支持。

医院始终坚持“能蒙不西、先蒙后西、蒙西医结合”的治疗理念，结合蒙医传统疗术（如银针、火灸、药浴、沙疗等），在慢性病及疑难杂症领域形成了独特优势。现有国家中医(蒙医)优势专科1个，自治区中蒙医优势专科建设项目3个，市级重点专科建设项目6个，自治区重点学科1个，院士工作站1个，岐黄学者、国家名中蒙医工作室3个，博士工作室2个，年均服务患者超30万人次，年住院患者近5000人次，挖掘整理开展的传统蒙医诊疗项目70多项。

自建院以来，医院始终坚持以“敬畏天地 顺应自然 守护健康 缔造幸福”为办院宗旨，秉承“厚德   精术   传承   创新”的院训，以“蒙医为主体、科技为支撑，突出蒙医药特色，逐步建立蒙医药标准体系”为发展战略，坚持以“管理科学 技术精湛 服务优质 以人为本”的办院理念，全面协调可持续发展，突出蒙医特色。不断解放思想、深化改革，通过重点打造特色专科，逐渐向医养结合的发展模式转变。在传承和发扬传统蒙医药文化的同时，实现蒙西医并重的发展路径，提高医院综合救治能力，从而满足了群众多元化的健康医疗需求。

随着医院综合服务能力和核心竞争能力不断的提升，医院先后荣获自治区首批“蒙医中医名院”“中国优秀医院”、自治区“模范医院”、自治区“平安医院示范单位”、全区“民族团结进步模范集体”、“中国民族卫生医药发展贡献奖”。